生态学学科相对稳定的学科方向有三个：

（1）植物生态学：聚焦于植物群落生态、生理生态与分子生态。主要关注植物对水盐运移的适应机制、耐盐碱植物的土壤改良效应、耐盐碱植物抗逆分子机理、植物资源引种培育与开发利用、盐碱地造林方法与原理、种间关系研究等方面的研究。

（2）生态系统生态学：聚焦于生态系统结构、过程、功能和服务。主要关注机场生态环境监测与功能评价、生物地球化学循环及耦合关系、生态系统过程与服务功能对全球变化的响应机理、生态系统碳汇提升、生物多样性保护与利用、盐碱地高效生态农业等方面的研究。

（3）修复生态学：聚焦于生态环境退化机理与质量提升理论与技术。主要关注泥质海岸带退化机理与生态修复、滨海困难立地根际微生态修复、污染物迁移转化、污染物生物降解材料与装备研发、污染修复模式、生物入侵防治等方面的研究。