生态学学科成立于2004年，为山东省以及山东航空学院重点学科，主要关注黄河三角洲盐碱地、湿地、农林业等典型生态系统的生态环境问题，提出黄河三角洲生态系统可持续管理、资源综合利用和生态系统固碳策略，为黄河流域下游经济社会可持续发展提供科技支撑，服务“黄河流域生态保护与高质量”“碳达峰碳中和”国家战略。

依托山东省黄河三角洲生态环境重点实验，共建有山东省高等学校黄河流域湿地生态保护与盐碱地治理协同创新中心。拥有环境工程和农田水利2个专业硕士点；建有全国科普教育基地、山东省“三星级”科普基地、山东省科普专家工作室等多个科普平台；与北京师范大学等共建有“黄河口湿地生态系统教育部野外科学观测研究站”等4个野外研究基地；拥有山东省高校黄大年式教师团队1个，省级科研创新团队8个。

现有学科成员48人，博士46人，高级职称14人，博士生导师5人，硕士生导师21人。柔性引进国家杰出青年基金获得者、长江学者1人，国家青年拔尖人才1人；拥有享受国务院政府特殊津贴、泰山学者青年专家、山东省先进工作者等10余人次。学科成员担任中国生态学会理事、中国植物学会水生植物资源与环境专业委员会常务委员等16人次；担任Functional Ecology副主编，Resources, Environment and Sustainability、《湿地科学》等国内外期刊的青年编委25人次。

近5年，生态学学科承担各类项目160余项，获得各类科研经费3000余万元。其中，国家级科研项目15项、省部级科研项目22项。获市厅级以上科研奖励34项；授权国家发明专利12项；出版学术著作7部，登记软件著作权10项，发表学术论文260余篇，组织召开国内外学术研讨会6场。